1. 取样
拿到样品后用毛细管蘸取少量的样品放入离心管中，加入相应的溶剂将样品溶解，标号后作为对照。
2. 跑板
将取出的样品与要分离的样品点在同一块硅胶板上进行跑板，确定第几个点是将要分离出来的样品。
3. 装柱
将少量的棉花（棉花太少会露出硅胶，太多过滤的较慢）塞入柱子低端防治硅胶露出，配制硅胶溶剂时浓度应适当（浓度过大易造成干柱，溶度过小会大量浪费溶剂），将硅胶装入柱子直径的15—20倍高即可（柱子过高浪费时间且没有必要，柱子过低会造成物质没有分离开就应经被洗下）。
倒入一定量的硅胶之后将硅胶压实，然后将溶液压**和硅胶面向近处，重复加入硅胶到达预定的高度，然后加入一定量的无水硫酸钠（作用是防治在加样时将硅胶面冲的变形），然后用手稍微弹动柱子将无水硫酸钠弹平，在溶剂将柱内壁的硅胶及无水硫酸钠洗净。
4. 加样
将样品用溶剂溶解后加入柱内（加入溶液时从中间像外圈旋转滴加，不要将柱面冲出坑），并用溶剂反复洗瓶子3遍左右（洗瓶子时将溶剂沿磨砂口加但不能碰到瓶内壁，否则会污染试剂），将洗后的液体转移**柱子内。
5. 过柱
先用滴管沿柱内壁加入溶液，溶液到达一定高度后再将配制的溶液倒入到柱子上面的球型漏斗内，加压，先用锥形瓶接取前面柱内的溶剂，然后当溶液到达一定的高度时开始用试管接，然后不断的检验试管中是否有样品洗出，当从有样品洗出到没有时，**个样品就被完全洗出，跳跃的点一定数量的点，然后进行跑板，确定没有自己要分离的样品后就可以倒掉，继续洗柱子。换取极性稍大的溶剂，分离到第二个样品后同**个做同样的处理，直**得到自己要的样品。
6. 旋干
将的的样品转移**圆底瓶中旋干，在将样品瓶安装好后，先打开冷凝系统和加热系统，然后打开旋转和抽气，缓慢关闭活塞，此时不停的观察是否有气泡，若有气泡应放入一定气体，然后缓慢关闭直**没有气泡，旋干后用油泵抽气（油泵的真空度比选转蒸发仪的真空度更大，能抽的更干）然后放入称量过质量的小瓶中，封口后放入冰箱内保存。
